Koyomi bergabung dalam pertemuan bola basket putri dan menanyakan kesamaan apa yang dimiliki kelima orang hilang tersebut. Dia mencapai keyakinan tertentu saat dia mendengarkan mereka dan segera pergi. Sementara itu, siapa yang mengunjungi Suicide-Master, saat dia menunggu sendirian di kediaman Kanbaru…? Meski masih ada jejak masa singkatnya menjadi vampir, siswa sekolah menengah tahun ketiga Koyomi Araragi menjadi manusia lagi. Dia menemui orang lain dengan masalah supernatural mereka sendiri dan menemukan bahwa dia dapat berempati. Koyomi terlibat dalam kehidupan mereka, berusaha membantu mereka dan sesekali meminta nasihat dari Meme Oshino, pria tunawisma yang membantunya menjadi manusia kembali. Ceritanya berpusat pada Koyomi Araragi, seorang siswa sekolah menengah tahun ketiga yang baru saja selamat dari serangan vampir, dan mendapati dirinya bercampur dengan segala macam penampakan: dewa, hantu, mitos, dan roh. Siswa sekolah menengah Koyomi Araragi selamat dari serangan vampir dan tidak bisa berhenti terlibat dengan segala macam penampakan—tetapi dia akan menghadapi tantangan terbesarnya: melindungi kedua adik perempuannya! Karen dan Tsukihi sangat menjunjung keadilan, dan Koyomi harus menjaga keamanan mereka sembari mencari penyebab penampakan mereka. Tsubasa dan Hitagi mengetahui bahwa Koyomi telah hilang dan mendesak mereka melalui pesan teks untuk tidak mencarinya. Namun, saat dia tidak ada, penampakan berbahaya baru mulai muncul dan menargetkan Tsubasa, dan Nadeko yang harus mencoba menanganinya sendiri. Sementara itu, Koyomi Shinobu dan Mayoi menghadapi masalah serius mereka sendiri. Selama bulan Oktober tahun ketiganya di sekolah menengah, Koyomi Araragi diperkenalkan dengan siswa pindahan bernama Ougi Oshino oleh adik kelasnya Kanbaru Suruga. Ougi memberi tahu Koyomi bahwa dia memiliki sesuatu yang ingin dia konsultasikan dengannya. Saat dia menggambar peta SMA Naoestu, dia menemukan sesuatu yang aneh di sana. Penemuan ini mengungkap sebuah kisah yang tidak dimaksudkan untuk diceritakan, dan ini membuat kehidupan SMA Koyomi sangat berbeda. Kisah inilah yang mengungkap “apa” yang menjadikan Koyomi Araragi. Inilah kisah yang mengungkapkan “permulaan” dari segalanya. Setelah lulus SMA, kisah Koyomi Araragi pun berakhir. Kali ini, semuanya benar-benar berakhir. Namun, kisah gadis-gadis yang diselamatkan Araragi belum berakhir. Ini adalah sebuah prekuel, atau mungkin sekuel dari perjuangan mereka di masa muda.