Kelas tersebut kalah tipis dari Kelas A pada ujian akhir, dan diturunkan kembali ke Kelas D. Namun, siswa menunjukkan pertumbuhan sepanjang tahun. Horikita, khususnya, telah berkembang seiring dengan permintaan pemimpin untuk membubarkan aliansi dengan Kelas B. Kiyotaka Ayanokoji baru saja mendaftar di Sekolah Menengah Atas Koudo Ikusei Tokyo, di mana dikatakan bahwa 100% siswanya melanjutkan ke perguruan tinggi atau mencari pekerjaan. Tapi dia berakhir di Kelas 1-D, yang penuh dengan semua anak bermasalah di sekolah.\n\nTerlebih lagi, setiap bulan, sekolah memberikan poin kepada siswa dengan nilai tunai 100.000 yen, dan kelas tersebut menerapkan laissez-faire. kebijakan yang mengizinkan berbicara, tidur, dan bahkan sabotase selama kelas.\n\nSatu bulan kemudian, Ayanokoji, Horikita, dan siswa Kelas D mempelajari kebenaran sistem yang diterapkan di sekolah mereka… Tokyo Metropolitan Advanced Nurturing Sekolah Menengah Atas tampak seperti surga, namun kenyataannya, ini adalah sistem meritokrasi yang ekstrem. Di kelas orang-orang yang kurang berprestasi, Kiyotaka mulai bekerja dengan Suzune, yang berupaya untuk naik lebih tinggi. Setelah menjalani tes bertahan hidup di pulau tak berpenghuni, mereka dapat menikmati kapal mewah, namun tes berebut kelas baru akan dimulai.