Nasib seluruh alam semesta berada dalam bahaya saat Samurai Jack menghadapi Aku. Seorang pejuang hebat dipindahkan ke masa depan yang jauh oleh penyihir jahat yang bisa berubah bentuk, Aku. Dunia telah menjadi tempat yang suram di bawah pemerintahan Aku, dipisahkan menjadi suku-suku yang fantastis dan diperintah oleh panglima perang robot jahat Aku. Jack menjelajahi lanskap asing ini untuk mencari portal waktu yang dapat mengembalikannya ke waktu asalnya sehingga dia dapat \”membatalkan masa depan Aku!\”.